Merle Hillmer studiert Gesangspädagogik und Kirchenmusik an der Hochschule für Musik und Theater „Felix Mendelssohn Bartholdy“ in Leipzig, u.a. bei Prof. Ilse-Christine Otto (Gesang), Prof. Florian Maierl (Chorleitung) und Prof. Martin Schmeding (Orgel), aktuell im Masterstudiengang. Meisterkurse bei Henry Fairs, Léon Berben, Hans Davidsson, David Titterington und Nathan Laube und ein ERASMUS-Jahr am „Royal Birmingham Conservatoire“ ergänzen ihre musikalische Ausbildung. Sie ist Preisträgerin des „C.A.O.S“ Cambridge Orgelwettbewerbs und des RCO/IAO Edinburgh Orgelwettbewerbs.
Sängerisch ist sie in zahlreichen Ensembles tätig, beispielsweise im Vocalconsort Leipzig und dem Gellertensemble, und gibt Stimmbildungseinheiten im GewandhausKinder- und Jugendchor.
Als Dirigentin leitet sie seit Oktober 2021 den Kammerchor Coro Piccolo und seit 2022 den deutsch-französischen Chor "Chorbeau" Leipzig.